Shun Uruma, un élève de sixième, est persécuté depuis toujours par ses camarades. Surnommé le Cobaye A , le jeune garçon ne trouve du réconfort qu'auprès de ses parents et de son petit frère. Mais lorsque sa précieuse famille lui est arrachée par nulle autre que ses tyrans, Shun perd tout espoir. Avec l'aide de son grand-père, ancien membre d'un bataillon secret, il va redonner un sens à sa vie grâce à sa soif de vengeance.

Quatre années se sont écoulées depuis que la famille de Shun Uruma a été assassinée... Après avoir juré de se venger, le jeune homme choisit comme première cible l'un de ses cinq tyrans, Katsumi Senkôji, et l'observe tel un prédateur à l'affût de sa proie, au cas où ce dernier se serait repenti. Pourtant, Katsumi finit par capturer Shun et par lui dévoiler son véritable visage. Toutefois, il ignore encore qu'en réalité, c'est lui, la victime... Désormais, plus rien ne peut arrêter le lycéen assoiffé de vengeance. La nuit s'annonce longue...

Après avoir fait de Katsumi Senkôji sa première proie, Shun Uruma passe à sa prochaine cible : Yûga Ushiro, une véritable crapule qui trempe désormais dans le proxénétisme et le trafic de drogue. Mais alors que Shun vient en aide à son amie Chizuru, Yûga découvre son plan d'attaque. Ignorant ce revirement de situation, Shun, déterminé à accomplir sa vengeance, s'apprête à pénétrer dans le repaire de son ancien tyran, gardé par ses hommes de main…

Après Senkôji, c'est au tour de Ushiro de baigner dans son sang. En s'occupant de ses deux proies, Shun a annoncé à ses trois bourreaux que sa vengeance avait commencé. Résultat, Hiro Madoka, le plus peureux d'entre eux, décide de réagir en lui déclarant la guerre... Mais Shun a mis son plan sur pause afin de préparer la pièce de théâtre pour le festival culturel de son école. Le jour J, Madoka sort de l'ombre et assouvit ses désirs sur Kaname Shirakawa, l'ancienne camarade de Shun...