Une classe de jeunes Japonais rentre en train vers Tokyo lorsque, sous un tunnel, c’est l’accident. Teru, Nobuo et Ako échappent à la mort. Mais enterrés vivants, comment ne pas sombrer dans l’obscurité ?

Les relations se dégradent entre Teru et Nobuo. Ce dernier sombre dans  la fureur et la folie. Teru, lui, s’enfuit avec Ako alors que la terre tremble à  nouveau. Ils trouvent enfin une issue qui les conduira à découvrir peu à peu  ce que le monde et ses habitants sont devenus…

Teru et Ako ont échappé de peu à la tornade de feu qui s’était répandue sur la ville en ruine dans laquelle ils avaient trouvé refuge. La méfiance règne avec les militaires qui les ont sauvés et les blessures de Teru obligent Ako à prendre les décisions seule. Elle ne va cependant pas tarder à découvrir une réalité encore pire que celle qu’ils avaient imaginée…

Coincés dans l’hôpital où ils doivent récupérer un vaccin pour Teru,  Ako et Nimura sont poursuivis par la folie meurtrière des hommes  de la ville. Des nuages noirs envahissent peu à peu le ciel pendant que Iwada  lutte pour tenter de les retrouver et les sauver de ces hommes  qui n’ont plus rien d’humain.

Teru est seul. Il parvient à atteindre Tokyo avec l’espoir de retrouver  Ako saine et sauve. Mais la ville déserte ne lui renvoie que l’immensité  du vide qui l’habite. Pourtant, sous terre, une radio fonctionne...