Tokyo, XXIe siècle. Pour enrayer le réchauffement climatique, les villes du monde entier sont sommées d’accélérer leurs politiques de reforestation urbaine.Akira, un jeune lycéen, prend le métro tokyoïte pour retrouver Yui, l’amie à qui il n’a jamais su avouer ses sentiments. Mais suite à une soudaine coupure de courant, lui et d’autres passagers  se retrouvent bloqués sous terre.  Quand enfin Akira regagne la surface, le monde n’est plus le même  : des plantes gigantesques se sont mises à attaquer les humains…

Tokyo est entièrement contrôlée par les plantes. Déterminé à se battre pour tenir la promesse qu’il a faite à Yui, Akira décide de retourner à la surface en compagnie d’Eudyptes pour aller chercher des armes. Accompagnés d’un petit groupe de survivants, ils profitent du fait que les plantes géantes ne sont pas actives la nuit pour se mettre en route… Mais un terrible danger les guette !

Depuis sa prise de contrôle par les plantes, la ville de Tokyo est devenue un véritable lieu de désolation. Pour se procurer des armes, Akira et son groupe rejoignent un quartier où s’est installée une communauté de fabricants d’armes menée par une femme du nom de Shiratori. C’est là-bas qu’ils font la rencontre de Nano, un jeune homme à l’identité mystérieuse, et qu’Eudyptes leur fait une prédiction des plus inquiétantes qui ne tarde pas à se réaliser… Une nuée d’insectes s’abat sur eux telle une vague de désespoir.

Conformément aux prédictions d’Eudyptes, Akihabara est assailli par un essaim de bombyx qui transforme le quartier en un véritable enfer. Akira et ses compagnons tentent de se défendre avec les armes que leur ont fournies les artisans de Kanae, mais le combat tourne rapidement à l’avantage des insectes et de la néo-humaine qui les dirige. Mais alors que tout semble perdu, les liens unissant Akira et Eudyptes sont finalement révélés, ouvrant la voie à une riposte impitoyable !

Grâce aux conseils stratégiques d’Eudyptes, lequel a remonté le temps afin de sauver l’humanité de l’extinction, Akira et ses compagnons parviennent finalement à vaincre la néo-humaine et les bombyx géants qu’elle contrôlait. Mais la menace prend alors une autre forme, rendant plus incertaine encore l’issue du combat…Un chapitre se referme tandis qu’un autre commence avec celle qu’Akira s’est juré de retrouver : Yui !

La gare de Nerima est en proie à la panique suite à la propagation d’une épidémie causée par le "pollen de la mort" d’un mystérieux arbre géant. Mais alors qu’un certain Ryûkôden instrumentalise cette peur au service de son ambition, certaines personnes contaminées se transforment en de terribles monstres appelés "hommes d’osier" et se mettent à attaquer Yui et ses compagnons !

Yui et ses compagnons parviennent à l’arbre géant qui dissimule la matière dont ils ont besoin pour fabriquer le vaccin qui guérira leurs amis contaminés par le “pollen de la mort”. Mais alors qu’il ne leur reste plus que deux heures avant le lever du soleil et le réveil des plantes, ils se retrouvent confrontés à un néo-humain bien décidé à leur barrer la route... L’étau se resserre inexorablement sur le groupe.

Contaminé par le pollen de la mort, Akira s’est transformé en une machine à tuer dénuée de toute humanité. Yui parviendra-t-elle à le sauver de la malédiction des « hommes d’osier » ?! Quant à Eudyptes, quel terrible secret va-t-il découvrir au sujet de la machine à remonter le temps ?!  Espoir et désespoir, passé et futur… tout semble désormais connecté. Le monde sera-t-il sauvé ? Réponse dans cet ultime volume !