Le prestigieux lycée Hiiragi, à Ikebukuro, est connu comme un établissement «VIP». Mais en réalité, c'est un lycée à problèmes, qu'une clique d'élève nommés les «Spé-A» dirige à sa guise. C'est sans compter sur l’arrivée d’Hayato Jûmonji alias Kamen Teacher. Avec Gôta Araki, un nouveau professeur entré en fonction au même moment que lui, ils vont faire revenir la lumière dans ce lycée prisonnier des ténèbres.

Apprenant la manière dont Hayato Jûmonji alias le Kamen Teacher a forcé les Spé-A de 1re A à effacer les photos volées de Rio, Mlle Fujita lui demande son aide, par l'intermédiaire de Gôta Araki. En effet, elle aussi est victime de ce genre de chantage. Jûmonji accepte, à condition qu'elle l'aide dans sa croisade pour rétablir l'ordre au sein du lycée Hiiragi. Mais les Spé-A préparent leur vengeance. Ils ont recruté des hommes de main pour se débarrasser d'Araki et de Jûmonji, en mettant leurs têtes à prix pour une somme phénoménale...

Kirishima avait engagé le Cartel Q Kawasaki pour se débarrasser de ses professeurs Jûmonji et Araki, mais son plan s'est retourné contre lui et il est désormais victime de leur chantage. Il n'a eu d'autre choix que de demander l'aide du Kamen Teacher, mais celui-ci l'attache en plein milieu du bowling désaffecté où le combat doit avoir lieu. La leçon de Jûmonji va-t-elle porter ses fruits ? 

Arisa Mizumori et ses deux complices des Big Five ont mis à exécution leur plan pour se débarrasser du Kamen Teacher et de ses partisans. Alors que Gôta est toujours en garde à vue pour des agressions qu'il n'a pas commises, le père de Riku est également arrêté sur de fausses accusations d'agression sexuelle, le restaurant des parents de Rio accusé de tromperie sur la marchandise, et la réputation de Mlle Fujita en passe d'être détruite. Alors que Riku est sur le point d'être tabassé par les gorilles du comité de discipline, Kyôji, qui a fait du karaté, vient en aide à son ami. 

Le Kamen Teacher a triomphé d'Arisa Mizumori et ses complices, et ses partisans pensent que la paix va enfin revenir au lycée Hiiragi. Mais Arisa n'a pas abandonné l'idée de se venger et fait appel aux derniers membres des Big 5 : le président du Conseil des Élèves  Ryûya Kunô, et sa sœur Sakuya. Ces derniers mettent au point un plan diabolique pour démasquer le Kamen Teacher et le faire arrêter par la police. De plus, leur père est un entrepreneur véreux, lié au crime organisé, et tient en son pouvoir le conseil d'administration du lycée ! Élèves et professeurs se mobilisent, mais...