Shinichi Kudo est un jeune homme de 17 ans, joueur de foot accompli, et détective. Il est brillant et son modèle n'est autre que le héros de Conan Doyle, Sherlock Holmes. Au cours d'une enquête, il surprend un marché douteux mais est fait prisonnier. Plutôt que de le tuer, les bandits menés par un homme en noir lui font absorber un poison bien étrange. Shinichi se voit alors transformé en garçonnet. Ses parents vivant à l'étranger, il se tourne vers Agasa, mélange de Doc de "Retour vers le Futur" et de Q, le savant fou inépuisable fournisseur de gadgets de James Bond. Pour son amie d'enfance, Ran, Shinichi devient Conan Edogowa, un lointain neveu du professeur. Recueilli par Ran et son père, un détective sur la touche, Conan mène l'enquête à travers lui. Le jeune homme à l'aspect d'enfant, n'aura de cesse de retrouver sa véritable apparence.

Premiers soupçons de Ran à propos de l'identité de Conan.

Énigmes principales : Le chef de la famille Takemoto est assassiné en chambre close sur un bateau de croisière. Enquête sur la disparition d'un petit garçon. Premiers soupçons de Ran à propos de l'identité de Conan.

Dans ce 4ème tome de Détective Conan, réapparition des hommes en noir dans le train.

La dernière enquête voit l'entrée en scène une femme qui prétend être la mère de Conan...

Dans ce 6ème tome de Détective Conan, on découvre le visage des parents de Shinichi.

L'enquête autour du piano est une des plus tristes qui soit mais aussi une des plus intéressantes !

Conan affronte un personnage directement tiré d'un roman écrit par son père.

Enigmes principales: Une cachette bien dangereuse. Les retrouvailles. Meurtres en série. Invité avec Ran et son père à l'anniversaire de Reika Yotsui, fille unique d'un riche homme d'affaires, ils se retrouvent au coeur d'une histoire de meurtre. Reika disparaît, et un des invités, M. Nikaido est retrouvé noyé. Reika est finalement retrouvée mais morte, noyée dans sa baignoire. Conan a découvert l'identité du coupable et s'apprête à nous la dévoiler ! ! !
Kogoro résout un meurtre presque tout seul...

Enigmes principales : Une cachette bien dangereuse. Les retrouvailles. Meurtres en série. Au cours d'une affaire, Shinichi est provoqué par un certain Hattori, détective lycéen tout comme lui, mais professant dans la région du Kansai. A la surprise générale, le vrai Shinichi réapparaît alors pour relever ce défi. Depuis, ce miracle qui permit à Conan de redevenir ce qu'il était, ne se reproduit malheureusement plus. En vacances aux sports d'hiver, Kogoro, Ran et Conan sont à nouveaux confrontés à un meurtre mystérieux : le professeur Oyama a été assassiné dans son luxueux chalet. Grâce à un message laissé par la victime avant de mourir, Conan semble avoir découvert l'identité du coupable !

Enigmes principales : Mort en direct. Un personnage clé. La pièce du jeûne. Face à Conan, se présente un rival de taille : Heiji Hattori, fils du commissaire principal de police de la ville d'Osaka. Garçon rempli d'orgueil et un brin prétentieux, il vient défier Shinichi dans ses enquêtes et doute sérieusement des capacités de Kogoro à les résoudre lui-même. A l'école Conan retrouve sa bande de copains... Mais avoir des camarades de jeu qui aiment jouer les détectives, ce n'est apparemment pas de tout repos...

Enigmes principales : Le coffre au trésor du professeur. A la recherche de la bombe. Réunion chez Mycroft. Une énigme difficile qui fait appel à la connaissance des syllabaires japonais (hiragana et katakana). Conan retrouve la trace des hommes en noir. Hattori revient chercher Shinichi.

Enigmes principales : Les triplés. Un suicide douteux : la fleur et le papillon. La tragédie du monstre Goméra. Hattori découvre la véritable identité de Conan. Aoyama fait un clin d'oeil aux films du genre Godzilla.

Enigmes principales : Les numéros de téléphone. Questions dans les feuilles mortes. Une étrange réunion. Si Shinichi a réussi à tromper tout le monde, le secret de son identité a été percé par un détective lycéen venu du sud du Japon : Heiji Hattori. Conan, Ran et Sonoko partent au ski, et rencontrent par hasard une de leurs anciennes maîtresses d'école. C'est là qu'une nouvelle affaire commence dans le chalet où ils devaient passer la nuit ! Conan sait que la clé du mystère réside dans "un fait datant de 3 ans". Ainsi commence l'enquête, mais... Ran commence à avoir de sérieux doutes sur l'identité de Conan. Les parents de Shinichi participent pour la deuxième fois à une enquête du fiston.

Enigmes principales : Les larmes de la vérité. Une voix ressemblante. Lécher de pouce. Le bandage ensanglanté. Un jour, pour les besoins d'une affaire, Kogoro est appelé par le grand patron du groupe "Nagato". Mais au cours de la réunion organisée pour l'anniversaire de M. Dosan Nagato, un meurtre a lieu. Il semblerait que tout le monde ait été témoin : le coupable serait Hideomi, le fils aîné de M. Nagato. Ran joue les détectives : grâce à Shinichi, elle résout une enquête. Aoyama met en scène un groupe de musique pop, les Two-mix qui ne sont autres que les véritables doubleurs de la série télévisée éponyme. Hattori intervient dans la dernière enquête du volume.

Enigmes principales : L'assassin était en blanc. Le mystère de l'école. La rencontre. La manigance des sculpteurs. On se croirait véritablement dans un roman de Maurice Leblanc : un cambrioleur surnommé l'insaisissable 1412 prévient la police et les meilleurs détectives qu'il va s'emparer d'un précieux joyau à leur nez et à leur barbe. Conan ne peut pas manquer ça et se mêle à l'enquête. C'est l'apparition d'un adversaire de taille pour notre jeune détective qui va devoir remuer toutes ses cellules grises pour contrer les plans du malfaiteur... Conan et Heiji : après la rencontre, le secret percé, c'est leur première collaboration sur une enquête. Arrivée en grande pompe d'un nouvel adversaire pour Conan : Kid l'insaisissable, une sorte de gentleman cambrioleur.

Enigmes principales : Trois ruses. Mini-enquête des Détectives- Boys. L'horloge qui... Les acteurs réunis. Un jour, Kogoro Mouri, devenu grâce à Conan la véritable star des détectives, est contacté par le célèbre acteur "Kosaburo Hijikata" et accompagne ce dernier à son appartement. C'est là que M. Hijikata, en compagnie de Kogoro, Ran et Conan, voit son épouse Isami s'effondrer sur le balcon de leur voisin, Okita, jeune acteur en devenir. L'identité du coupable ne semble pas laisser de doute... Pourtant, Conan doute. La mère de Ran est de retour. Une enquête qui se résout avec des jeux de mots : pas simple...

Kogoro est invité par un acteur connu qui a besoin de l'aide du détective. L'homme compte en effet jouer le rôle d'un policier dans son prochain film, et aimerait l'avis d'un professionnel. Alors qu'ils discutent du rôle, la femme du comédien est retrouvée morte dans la chambre voisine. Tout semble accuser le voisin, propriétaire de l'appartement... Ensuite, il est invitée avec Ran et Sonoko à l'anniversaire d'une jeune femme qui se dit être le premier amour de Shinichi (rien que ça). Mais celle-ci manque alors de mourir dans l'incendie de sa maison, alors que tous les autres sont au karaoké. Kogoro conclut à la tentative de suicide, mais pas Conan. Peu après, une nouvelle élève du nom de Ai Haibara arrive à l'école primaire. Ayumi la trouve bizarre et en parle à Conan qui, lui, a d'autres choses à penser. Il semblerait qu'il a retrouvé les hommes en noirs. Cependant, Ai se montre être plus qu'une simple petite fille. Qui est-elle vraiment?

Enigmes principales : L'écrivain qui disparu mystérieusement. La ville des bons vivants. Les 56 000 otages. Ai Haibara est sa nouvelle camarade de classe : tout comme Conan, elle a été victime du terrible poison. Conan et sa "famille" se sont rendus à Osaka sur une invitation de Hattori. Là, Conan et Hattori, confrontés à un tueur en série, font des merveilles et résolvent cette affaire avec brio. Un jour, Conan et sa bande de petits détectives vont assister à un match de foot pendant lequel un homme armé prend en otage tous les spectateurs, menaçant de tuer quelqu'un si une forte somme ne lui est pas versée avant la fin du match. Conan arrivera-t-il à déjouer ce plan en si peu de temps ? Ai révèle un peu plus de sa personnalité. Invité par Heiji, Conan se rend à Osaka et enquête sur un serial-killer...

Enigmes principales : Dans un champ de neige. Trop d'amour pour une soeur. Invitation dans un château isolé. Un jour le groupe des jeunes détectives et le professeur Agasa vont camper mais ils se trompent de route et arrivent dans un étrange château isolé. A l'intérieur de celui-ci, Conan découvre une porte secrète. C'est alors qu'il est frappé violemment par quelqu'un qui se trouvait derrière lui... ! ! La première énigme qui utilise l'internet. Mais surtout, le grand retour de l'insaisissable Kid !