Nagi Taira était le meilleur tueur à gages, mais il est plongé dans un état végétatif depuis le jour où il a reçu une balle dans la tête pour protéger sa petite soeur. Cependant, lorsqu'il sent une pulsion meurtrière dirigée vers lui, il reprend temporairement conscience. Afin de retrouver son état normal, Nagi va continuer sa rééducation en affrontant de puissants ennemis à l'aide de son fauteuil roulant !

Nagi et Shizuka ont réussi à repousser l'attaque des frère et soeur Kurosaka, des assassins qui viennent de l'Académie qu'ils fréquentaient autrefois. Ensuite, ils ont été forcés de se déplacer de planque en plaque dans l'île de Guicheng afin d'échapper à leurs poursuivants, mais leur ancien professeur qui dirige l'Académie a envoyé un nouvel assassin redoutable à leurs trousses...

Nagi a revu son professeur dans un monde psychique où une lune noire domine les cieux. Mais le frère de Shizuka a refusé l'offre de son ancien "instructueur" qui lui proposait de devenir un être "parfait" comme lui. Même s'il est "inachevé", Nagi a décidé de vivre comme un être humain avec sa soeur. La bataille finale est sur le point de commencer...

Ce récit se déroule entre les murs de l'Académie, trois ans avant l'affrontement mortel qui opposera le professeur à Nagi et ses compagnons sur l'île de Guicheng. Que s'est-il donc passé à cette époque, lorsque le grand frère de Shizuka occupait la place de premier élève de cette école pas comme les autres ? Et comment les protagonistes de cette histoire en sont-ils arrivés à leur situation actuelle ? La vérité, qui n'avait jamais été racontée jusqu'à présent, est enfin révélée !!

Après plusieurs années, Yûri retrouve Shizuka qui a quitté l'île de Guicheng et lui dit : "Je veux ressusciter le Tank Chair". Grâce à ces quelques mots prononcés avec détermination, Shizuka retourne sur l'île de Guicheng. Les deux filles décident alors de passer à l'action pour ramener Nagi parmi elles...

Après que les âmes de Nagi et du professeur ont été séparées, le grand frère de Shizuka a repris connaissance. Afin de l'aider à retrouver ses forces, sa soeur s'occupe de sa rééducation en lui organisant des combats. Mais tout cela n'empêche pas pour autant Shizuka d'être intriguée par Nina, l'enfant que Yûri a affrontée sur le paquebot Takara. Déterminée à percer le mystère qui entoure cette petite fille qui ressemble tant à Nagi, elle décide d'interroger le Docteur Radio qui va lui raconter la stupéfiante réalité...

Après s'être emparé du corps de Nina et du poulpe migraineux, Uzu a subi une transformation radicale. Afin d'accomplir la seule mission que son professeur lui a confiée jadis et qui consiste à éliminer Nagi, il pousse le Tank Chair dans ses derniers retranchements grâce à sa nouvelle puissance écrasante. Même s'il sait que cette mission n'a plus aucun sens, le triste combat de cet être qui n'a jamais pu devenir spécial pour qui que ce soit approche de sa conclusion...

Après avoir découvert l'endroit où se trouvait leur professeur porté disparu, les élèves de rang A se rendent dans son « jardin miniature », situé sous l'Académie. Là-bas, ils retrouvent enfin leur enseignant, mais il n'est plus celui qu'ils ont connu. Face à ceux qui ont osé pénétrer dans son sanctuaire secret, le professeur manifeste une hostilité farouche et se met soudain à attaquer ses élèves sans retenue...?!

Les élèves de rang A, dirigés par Waniguchi, ont tenté de capturer Nagi, la seule personne capable de leur apprendre la bonne méthode pour faire revenir le professeur qui n'est plus le même. Mais cette tentative a blessé quelqu'un qui compte beaucoup pour Nagi. Le jeune homme, animé d'une colère intense, se rend en territoire ennemi en compagnie de Naozumi qui soutient son corps affaibli par le "Cristal de la Mort". Son fauteuil roulant se transforme alors en Tank Chair modèle nº 9 : Octopowerassistance !