L’équipage de l’Edens Zero se rend sur True Island pour retrouver Homura. Il fait la connaissance d’un certain Natsu…

Homura se réveille enfermée dans une geôle sans savoir pourquoi. Natsu et Shiki, devenus amis instantanément, partent ensemble à sa recherche. Haru et sa bande recherchent «  l’oasis  »...

Haru a retrouvé « Oasis  » un Dark Bring, mais il n’était pas le seul à sa recherche. Shiki et Natsu font la connaissance de Julia et Java.

Natsu et Shiki sont attaqués par des monstres noirs. Homura, quant à elle, a réussi à s’évader. Tout le monde cherche oasis.

Haru, Shiki et Natsu unissent leurs forces pour affronter Genesis, mais la tâche est plus compliquée que prévue…

Haru, Shiki et Natsu n’arrivent pas à s’entendre sur la stratégie à adopter, et le groupe se sépare. Genesis veut reconstruire un monde nouveau  !

Alors que Genesis va lancer son offensive générale, Shiki, Natsu, Haru et leurs amis sont enfin réunis, prêts à riposter  !

Shiki, Haru et Natsu vont affronter Genesis à nouveau pour détourner son attention pendant que leurs compagnons cherchent la véritable oasis...

Lucy, Elie et Rebecca ont fini par trouver Oasis, mais la destruction s’avère plus compliquée que prévue…

Genesis a été vaincu et les secrets de l’île révélés. Il est temps pour chacun de regagner son univers, et de se dire au revoir, peut-être...