Jûzô Inui est un extend : on lui a implanté un revolver à la place de la tête. Depuis la grande guerre, il gagne sa vie dans cette ville grouillante d'autres extends, d'autres individus bénéficiant, comme lui, d'extensions mécaniques. Son business ? Résoudre des affaires dans lesquelles des extends sont impliqués. Un jour, Jûzô reçoit l'étrange visite d'un homme poursuivi par la police pour kidnapping. Il demande à Jûzô de protéger l'enfant qu'il a enlevé... !! Toutefois la gigantesque multinationale Beruhren va entrer dans le jeu... Jûzo est loin de se douter du guêpier dans lequel il vient de fourrer son nez !

Afin de sauver le jeune Tetsurô des griffes de Berühren, gigantesque multinationale qui règne sur la ville, Jûzô a utilisé son revolver. Mais l'utilisation d'extensions meurtrières étant interdite par la loi Extend, Jûzô risque désormais l'arrestation et le démontage par l'Agence pour la Reconstruction, qui contrôle les extends...

Le vrai coupable du massacre perpétré il y a dix ans s’est révélé être Mega Armed Sai, surnommé le « héros salvateur du pays ». Sa puissance est telle que Jûzô ne peut rien faire pour l’arrêter…! Soudain, à court de sédatifs, Jûzô ne parvient plus à contenir sa véritable force avec tout le danger que cela comporte…

Jûzô reçoit la visite surprise de Pepper, une mystérieuse jeune fille escortée par un Gun Slave Unit ressemblant trait pour trait à Jûzô et prénommé Seven. Jûzô comprend assez vite que les deux individus travaillent pour la multinationale Berûhren, mais Pepper affirme être venue pour des raisons personnelles : elle veut que Jûzô lui appartienne. Celui-ci refusant, il va devoir affronter Seven, un extend de même modèle que lui...

Alors qu'une organisation terroriste hostile aux technologies d'extension a pris en otage des personnes chères à Jûzô, celui-ci entreprend de les délivrer. Il va se retrouver face à Victor Steinberg, ennemi juré des extends et frère aîné de Mary recherché par elle depuis des années. Victor était aussi l'ingénieur attitré et l'ami de Jûzô pendant la guerre ! Des années plus tard, les destins des trois protagonistes s'entrecroisent de nouveau !

L'organisation terroriste Spitzbergen veut contraindre Tetsurô à prendre le contrôle de Jûzô. L'instigateur de ce plan machiavélique, le docteur Andy Wachowski, se révèle être l'auteur des premières théories sur les technologies d'extension, qui ont donné naissance aux extends. Pepper et le Gun Slave Unit Seven, qui travaillent pour la compagnie Berühren et en ont eux aussi après Jûzô, entrent à leur tour en scène. Que va faire Jûzô face à son créateur et face à un extend de même modèle que lui...?

Seven, à qui on a donné l'ordre de "tout détruire", est devenu incontrôlable. Jûzô a l'impression de voir en lui celui qu'il fut autrefois : un objet qui a renoncé à sa propre volonté. Afin de neutraliser Seven et pour s'affranchir de son passé, Jûzô libère sa force de Gun Slave Unit...!

Jûzô a été gravement blessé par Iô, un homme mystérieux se présentant comme le frère de Tetsurô. La clé pour soigner ce corps, conçu sous le sceau du secret militaire, serait cachée dans le camp de détention des extends. Jûzô et Mary décident d'en franchir l'enceinte et d'en explorer les recoins les plus profonds...

Afin d'être soigné, Jûzô s'est rendu dans le camp de détention des extends, le Wunderwender. Il y découvre, reposant dans les profondeurs, l'appareil n°12 qu'il avait tué de ses propres mains. Dans les ténèbres stagnantes, tous deux vont se confronter à leur passé...

Jûzô reçoit une requête particulière de la part du bureau de la Défense nationale, organe fondé à la suite d'un remaniement de l'armée : protéger la ville d'un danger causé par l'héritage négatif de la guerre. Pour y parvenir, Jûzô va se servir du pouvoir que l'appareil n* 12 lui a confié...

Tandis que Jûzô tente de résoudre l'affaire que Merrel Dutch lui a confiée, les cadres de Berühren sont révoqués et Iô, le frère de Tetsurô, fait défection. Alors que l'équilibre des pouvoirs au sein de Berühren est profondément ébranlé, Jûzô voit apparaître devant lui Suiso, son partenaire d'autrefois...

Iô, l'un des « frères » de Tetsurô, s'est soulevé contre Honest, qui contrôle Berühren. Jûzô, Tetsurô et Mary tentent de se mettre en travers de son chemin pour secourir Rinko, son otage, et récupérer le cerveau auxiliaire parallèle, mais...

Honest a pris le contrôle des extends de toute la ville en déclenchant le dispositif harmonie à large spectre. Jûzô, qui est parvenu à y échapper grâce à la dangereuse stratégie de son ancien camarade Suiso, part affronter Honest. Parviendra-t-il à accomplir l'ultime mission qui lui a été confiée ?