Finalement, c'est Chiaki qui remporte le concours de directeur d'orchestre. Notre jeune lauréat s'apprête à aller rencontrer M. Viera, mais Élise le kidnappe pour lui faire signer un contrat de force : Chiaki devra s'occuper de Stresemann pendant sa tournée internationale. Pendant ce temps, Nodame commence ses cours au conservatoire et, quand elle rencontre enfin M. Auclair, elle comprend que la route est encore longue...

Les cours ont commencé pour Nodame au conservatoire de Paris, mais le niveau est tellement élevé qu’elle se sent profondément découragée. Chiaki, de retour après quatre mois de voyages pour ses études de chef d’orchestre, tente de lui remonter le moral, en vain. Il suffira pourtant d’une séance pleine de gaîté avec son professeur de piano pour qu’elle retrouve confiance en elle-même, sans compter une soirée triomphale pour Chiaki qui, acclamé par le public, se laisse aller à quelques gestes d’affection...

Nodame et Chiaki passent Noël à Paris, la ville de l’amour. Mais Chiaki, exaspéré de ne pas assez voir Nodame, finit par lui annoncer qu’il la quitte ! Le printemps arrive avec une offre de chef d’orchestre permanent pour Chiaki, provenant de l’orchestre Roux-Marlet. Alors que Nodame rencontre par hasard Rui, la pianiste à l’origine de son grand passage à vide, Chiaki est confronté aux nombreux problèmes de son nouvel orchestre et la responsabilité de préparer en seulement trois jours son premier concert...

Nodame se présente à l’orchestre Roux-Marlet pour jouer du célesta, comme le lui a demandé Chiaki. Malheureusement, c’est à Rui, venue visiter par hasard cet orchestre où elle a joué autrefois, qu’on demande de jouer du célesta. Chiaki et Nodame n’ont pas d’autre choix que de la laisser faire. Cependant, Nodame a d’autres chats à fouetter, avec les examens du conservatoire qui se profilent à l’horizon. Le jury saura-t-il juger adéquatement son talent si particulier ? Chiaki, de son côté, après un premier concert qui frise le désastre, est bien décidé à relever le niveau par tous les moyens...

Les examens du conservatoire enfin passés, Nodame est invitée à jouer son tout premier récital dans un château en Bretagne grâce à la recommandation de M. Auclair, son professeur. Elle décide d’inviter Chiaki, Tanya et Kuroki à l’accompagner, mais arrivée sur place, elle découvre que le châtelain qui l’accueille est un passionné de Mozart ! Nodame doit trouver un moyen pour mieux comprendre ce compositeur, ce dernier n’étant pas trop sa tasse de thé. Elle trouve son bonheur dans ses correspondances un tantinet scatologiques avec sa famille…

Chiaki se lance dans une véritable révolution maintenant qu’il a été nommé pour diriger l’orchestre Roux-Marlet. Seulement voilà, la différence de niveaux est flagrante entre les nouveaux musiciens pleins d’entrain et les habitués qui n’ont pas envie de se donner du mal. Le temps se gâte. Chiaki saura-t-il faire à nouveau briller le soleil sur l’orchestre ? Nodame, quant à elle, commence sa nouvelle année au Conservatoire, mais une rivale est tapie dans l’ombre…

Le tout premier concert de Chiaki en tant que chef d’orchestre attitré se termine sur un vrai succès. Après avoir assisté à la représentation, Nodame retourne avec détermination vers la musique. C’est alors que Chiaki, à la recherche d’un endroit plus calme pour répéter, quitte l’appartement… Il ne sait pas encore quelle surprise l’attend lors de son prochain concert…

Pendant que Nodame prépare avec ardeur son tout premier récital privé, Chiaki, gêné par tout le boucan occasionné par les révisions de ses musiciens de voisins, décide de déménager pour pouvoir étudier au calme. Quand Nodame découvre la chose, c’est la catastrophe, sans compter la mère de Chiaki qui débarque en pleine préparation pour le déménagement…

Nodame et Chiaki sont en visite à Vienne où ils retrouvent Kyora, qui y étudie. La jeune femme se pose beaucoup de questions après s'être inscrite à un concours. Pendant ce temps, à Paris, Tanya et Yunlong s'entraînent avec acharnement pour ce même concours. Tous se battent pour leur futur, et sont en proie à bien des hésitations quand l'un des plus malchanceux du lot débarque enfin à Paris  !

C’est la seconde épreuve du concours international Cantona. Kyora, avec son jeu excellent, réussira-t-elle à atteindre l’épreuve finale ? Tanya saura-t-elle se dépasser et donner libre cours à son talent ?! Nodame, venue assister au concours, découvre un morceau qu’elle se sent destinée à jouer un jour, accompagnée de Chiaki ! Mais son élan est stoppé net par le hasard de la vie…

Chiaki se concentre sur les répétitions avec Rui avant le concert. À sa grande surprise, son jeu est exactement celui dont il rêvait… celui qu’il espérait un jour pouvoir produire avec Nodame… Cette dernière, au prix d’un énorme effort, a enfin obtenu l’approbation de M. Auclair. Elle subit cependant un sacré choc en découvrant qu’il donne également des cours à Rui. Quelle sera sa réaction en assistant au concert de Rui et Chiaki ?!

Après avoir subi un choc pendant le concert de Chiaki et Rui, Nodame, au bord du gouffre, accepte la main tendue par Stresemann... qui lui propose de faire ses débuts sous sa direction à Londres dans un de ses concerts. Mais elle n’avait pas prévu ce qui l’attendait après avoir fait des débuts des plus prometteurs ! Chiaki ne peut rien faire d’autre qu’observer les événements sans rien dire ni même intervenir...

Après quelques tergiversations, Nodame revient enfin à Paris. Entourée de ses amis, elle se remet à son piano, mais sa passion pour la musique semble avoir changé d’optique. De son côté, Chiaki part diriger un orchestre au Brésil. Se laissant emporter par le rythme de la samba, il prend une décision marquante. De retour à Paris et voyant l’état de Nodame, il se résout enfin à la laisser faire ce qui lui plaît... mais, ça c’était avant de l’entendre jouer à nouveau…

C'est le retour triomphal au Japon pour Nodame et Chiaki ! Chiaki, accompagné de l'orchestre r s,   va réaliser son rêve de diriger un opéra, et même si la représentation se fait dans un théâtre municipal avec peu de moyens, toute l'équipe est gonflée à bloc. Bûko Suganuma tient même le rôle principal et c'est Masumi qui s'occupe des costumes ! Quel genre de « Flûte enchantée » va donc naître d'une collaboration d'une si grande originalité ?!

Nodame et Chiaki vont-ils enfin jouer ensemble ?! L’ultime tome de la série !Il ne reste que très peu de temps avant la représentation de l’opéra mené par Suganuma. Chiaki fait la douloureuse expérience d’avoir à diriger un groupe d’interprètes dont les performances changent de jour en jour et qui ont du mal à trouver l’accord parfait. Mais quelle est donc la formule magique que Miné utilise lorsque Chiaki finit par paniquer ?!La conclusion tant attendue de cette histoire passionnante et passionnée, avec plusieurs bonus en fin de tome !