Kyû USAMI vit seul avec sa mère. Un jour d'été, il voit débarquer chez lui un robot qui ressemble à s'y méprendre à une jeune fille. Cette créature est venue étudier l'âme humaine, et le jeune Kyû va rapidement se rendre compte qu'on peut facilement tomber amoureux d'un être pourtant dépourvu de coeur...

Cela fait maintenant trois étés qu'Ichiko, la jeune fille robot, s'est installée chez Kyû pour apprendre les sentiments humains. Petit à petit, un nouveau sentiment naît chez elle ? Kyû est désormais collégien ! Hélas pour lui, il n'a pas obtenu de bons résultats aux examens du premier trimestre. À présent, ce n'est plus Ichiko, mais Néo, un autre robot encore en maintenance, qui s'occupe de l'aider à réviser. Ichiko et Néo semblent bien s'entendre, ce qui rend Kyû très perplexe. Ce dernier ne sait plus comment se comporter… Et c'est précisément lorsqu'il prend la décision de réduire la distance qui s'était installée entre Ai et lui, qu'une véritable évolution psychologique commence à s'opérer chez Ichiko…

Au cours d'un festival en plein été, Ai se décide enfin à révéler à Kyû ses sentiments, qu'elle gardait pour elle depuis si longtemps. Bousculés par les émotions, les deux amis grandissent de plus en plus, au fil des jours qui s'écoulent. Ichiko, quant à elle, reste la même... Les saisons passent et les liens unissant ces trois personnages se complexifient davantage...

Cela fait maintenant six ans que la jeune fille robot s'est installée chez les Usami. Elle a pu observer les humains, leur comportement et leurs émotions et ainsi, compléter son programme d'apprentissage. Il est bientôt temps pour elle de quitter sa famille, mais comment Kyû, qui n'a pas encore eu la chance de lui déclarer son amour, va-t-il réagir ? C'est la conclusion de ce manga boy meets robot girl.