Yoshimune, est le huitième shogun remplaçant le 7e shogun, une petite fille malheureusement décédée. La nouvelle maîtresse du palais entend faire changer les choses : elle n'apprécie en effet pas le faste et le luxe superflu qui était de mise au Pavillon jusque là, alors qu'il connaît des difficultés financières. Mizuno est pressenti comme celui qui pourrait être recommandé comme favori du shogun. En effet, remarqué par sa sobriété et son allure, Mizuno est invité à passer la nuit avec le shogun. Cependant, ils ignorent tous deux la règle qui veut que l'homme responsable de la perte de la virginité du shogun soit exécuté 10 jours plus tard.

Un drame a fragilisé le Japon ! Une terrible épidémie - la variole du Tengu qui touche exclusivement les êtres masculins - tue de nombreux jeunes et moins jeunes gens, sans distinction de classe. Le shôgun Lemitsu fait partie des victimes. Six ans plus tard, le pays ignore encore le décès de Lemistu, et à l'intérieur du palais, persécutions et manipulations se nouent afin de préserver ce secret. En se rendant au palais pour présenter les hommages de l'empereur au shôgun, Arikoto - jeune et beau religieux - ne se doute pas qu'il va se retrouver prisonnier des intrigues de la cour, faisant ainsi face à l'inhumanité des pratiques et des membres de la cour.

Bouleversement au pavillon des hommes ! Alors que la progression de l'épidémie de la variole du tengu ne ralentit pas, le couple que forment la shôgun Iemitsu et Arikoto pose un épineux problème au palais impérial. En effet, aucune naissance n'est venue bénir le couple. Dame Kasuga, l'intendante du palais, exige donc que Arikoto soit remplacé par un autre jeune homme, ressemblant à Arikoto et qui aura pour "tâche" de partager la couche de la shôgun et de lui donner un héritier...

Iemitsu, le nouveau shogun, décide de faire le ménage au sein du Pavillon. Elle ordonne le renvoi des hommes les moins doués en arts martiaux et les plus jeunes de son pavillon ! Au total, 100 hommes seront renvoyés et placés à Yoshiwara dans le quartier des plaisirs. Privé de leur sabre et sans pension, ils devront vendre leur corps au femme d'Edo pour survivre...

Tsugihito, fils d'une famille pauvre, était promis à une riche famille de daimyo. Lorsque l'héritière choisit un autre homme, il prend le nom d'Emonnosuke et entre au pavillon des hommes du shogun Tokugawa, où il finit par être nommé grand intendant. Cependant, sa présence n'est pas sans créer des remous au sein du pavillon et jusque dans la couche de sa majesté...

Le shogun vieillissant Tsunayoshi doit désigner un héritier, mais son père sénile bloque l'ascension du candidat le plus probable en faveur d'un jeune seigneur. Mais la politique et l'impopularité du shogun pourraient bientôt lui retirer tout choix.

Tokugawa Yoshimichi est morte. Le décès d'une femme jeune et en bonne santé soulève bien des questions. S'agit-il d'un assassinat ? Immédiatement, les soupçons se portent sur Tokugawa Yoshimune. En effet, il est dans l'intérêt de Yoshimune d'éliminer ses rivales sur le plan politique, et son réseau d'espions ne laisse pas d'inquiéter les occupants d'Edo...

Ieshige, la fille aînée du 8e Shogun, est atteinte d'une maladie. Pour l'entourage du Shogun Yoshimune, elle ne peut pas succéder à sa mère. Yoshimune doit prendre une décision, et face aux capacités cachées de Ieshige, elle annonce que cette dernière lui succèdera au poste de Shogun dans le respect des traditions. Mais la colérique Ieshige s'inquiète bien plus de satisfaire ses désirs que de gérer le pays en dépit des conseils et des soins précieux de sa domestique Otaku.

Ieshige lègue ses fonctions de Shogun à sa fille, Ieharu. Alors que cette succession suscite polémiques et jalousies, Ieharu va encore plus loin : elle rassemble les meilleurs spécialistes en médecine hollandais à Edo, afin d'effectuer des recherches sur la variole de Tengû. Gosaku, à présent scribe du pavillon, est chargé de diriger ces recherches et de donner des cours à tous ceux qui le souhaitent. La médecine hollandaise étant jusqu'à présent très mal vue au pavillon, Gosaku devra faire face à quelques difficultés... Relèvera-t-il le défi ?

Aonuma et ses disciples dans les études hollandaises sont plus près que jamais de trouver un moyen d'empêcher la propagation de la variole rouge. Mais alors même qu'ils travaillent sans relâche pour trouver le remède et par-là même l'avenir de leur pays, de sombres machinations politiques menacent leurs efforts... et leur vie !

Ienari se souvient d'Aonuma, un ancien médecin hollandais qui avait trouvé le vaccin contre la variole qui touche principalement les hommes. Ienari a toujours admiré cet homme qui l'avait sauvé étant enfant. Il décide donc, après la mort du médecin, de faire revivre la méthode Jintô et de la pratiquer sur l'ensemble des jeunes hommes du pays ! Cependant, sa mère est contre. Va-t-il réussir à aller jusqu'au bout ?

Ienari est déterminé à protéger son pays du fléau de la variole rouge, mais l'emprise cruelle de sa mère sur le pouvoir du shogunat signifie qu'il doit agir dans l'ombre pour atteindre ses nobles objectifs. Et maintenant qu'il a pu rallier à sa cause certains, non réfractaires aux sciences étrangères, qu'il est sincère dans ses objectifs, peut-être qu'un remède est enfin à portée de main !

La découverte du vaccin contre la variole du tengu a permis à la population masculine du Japon de revenir à la normale. Les hommes se sont habitués à être à nouveau forts présents dans la vie publique et au gouvernement. Ainsi, en tant que première femme shogun depuis plus de 60 ans, Iesada a de nombreux défis à relever. Mais la plus grande menace à laquelle elle est confrontée vient peut-être de son propre père...

Après la mort de son père, Iesada est ravie que le nouveau conjoint choisi pour elle soit intelligent, gentil et attentif à son passé traumatique. Mais Taneatsu, son prétendant, arrive à la cour avec son propre passé et de plus, il est chargé d'une mission qui pourrait l'opposer à son shogun bien-aimé.

Le shogun Iesada est décédée, mais contrairement aux précédents époux endeuillés, Taneatsu s'est vu refuser le droit d'intégrer un temple bouddhiste. Coincé dans le pavillon, il se lance alors corps et âme dans le soutien du nouveau shogun, sa "belle-fille" Iemochi. Mais des rumeurs sur la nature exacte de leur relation ainsi que l'arrivée du nouvel époux d'Iemochi risquent de ridiculiser ses nobles intentions !

Iemochi malgré son jeune âge fait tout pour tenir son rang et sa place, mais les relations entre la Cour impériale et le bakufu restent très tendues. Entre volonté d'ouverture de certains et protection des acquis et repli sur soi prônés par d'autres, les enjeux se multiplient. La prochaine union de Iemochi avec le Prince Kazunomiya pourrait-elle changer la donne et faire progresser les choses dans la bonne direction? Mais il semble qu'il ait eu duperie...! Qu'est-ce qui se cache derrière cet étonnant rebondissement ?

Kazunomiya n'est pas exactement l'époux qu'Iemochi attendait, puisqu'il s'agit d'une femme. Touteois, malgré son dégoût initial pour Edo et tout ce qui s'y rapporte, Kazunomiya fait de son mieux pour que les relations avec le shogun s'améliorent. Mais le monde au-delà de la sécurité du Pavillon est bien cruel, et le risque d'être découvert n'est peut-être pas le seul danger qui les menace.

Bien que Kazunomiya s'attendait à détester sa vie à Edo, son mariage avec le shogun Iemochi est devenu, de façon inattendue, une source de véritable réconfort pour elle. Mais maintenant, elle a pour projet de donner elle même la naissance au futur héritier, dans le plus grand secret. C'est Kuroki que le grand intendant désigne pour devenir le chûro de Kazunomiya...

Le temps des samurais touche à sa fin... Ancien bakufu et nouveau gouvernement, une nouvelle époque s'apprête à voir le jour ! Et voici que se conclut avec ce volume 19, cette immense et merveilleuse fresque uchronique nous ayant fait voyager dans le temps et partager intrigues de cour, relations diplomatiques, stratégies politiques et histoires d'amour. Et de se rappeler que l'histoire de cette saga démarre avec un virus qui, par sa haute mortalité ciblée, bouleverse l'ordre établi depuis des siècles !