Un an s’est écoulé depuis que Fujimaru Takagi a déjoué l’opération “boîte de Pandore” et a disparu sans donner de nouvelles… Aujourd’hui, le Third-i est mobilisé pour assurer la protection des douze plus importants chefs d’état de la planète, réunis lors d’un sommet à Tokyo, mais des hommes armés surgissent et les prennent en otage. Le Third-i ne tarde pas à découvrir que ces terroristes disposent d’un allié pour le moins inattendu…  La menace du Bloody Monday est plus pressante que jamais !

Le Third-i s'associe aux forces d'autodéfense pour lancer l'opération Exodus, laquelle doit permettre de libérer les otages détenus par les terroristes dans la Tokyo Neo Tower. Mais comme par le passé, Haruka se retrouve rapidement en danger et plusieurs fuites d'information laissent craindre la présence d'un nouvel espion au sein des services de renseignement japonais...

Les choses ne se passent décidément pas comme prévu : certains agents du Third-i sont laissés pour morts, Haruka est contrainte de se mettre en danger pour sauver la situation et Fujimaru est en passe d'être découvert. Réussiront-ils à déjouer les plans du conteur sans qu'aucun otage ne meure ? Rien n'est moins sûr...

Depuis sa tour de contrôle virtuelle, Fujimaru, alias « Falcon », gère les manœuvres pour contrer les terroristes. Ceux-ci sont progressivement neutralisés et le « conteur » se voit obligé de prendre la fuite. Nos jeunes héros secondés par le Third-I jettent leurs dernières forces dans la bataille. Sortiront-ils indemnes de cet ultime combat ?