Deux ans ont passé depuis la fin du légendaire Grand Tournoi d'Unabara durant lequel de nombreux combattants ont risqué leur vie afin de déterminer qui était le plus fort d'entre eux. Iori Sengoku, devenu le "guerrier sans égal", reçoit une invitation de la part du shogunat Tokugawa. Il va devoir défendre son titre. Ses adversaires seront des combattants triés sur le volet par le gouvernement. Leur nom : les Cent Lames du shogunat. Que le Tournoi Ultime commence !

Le shogunat a réuni les cent meilleurs guerriers afin de désigner lequel d'entre eux est le plus fort. On les appelle les « Cent Lames du shogunat » !! Iori Sengoku, le guerrier sans égal, se jette à corps perdu dans la bataille ! Tandis qu'Iori se dirige vers Edo, le premier à se mettre sur sa route est Hien Shiba, le « génie des génies » ! Afin de vaincre Hien, qui assène des coups imprévisibles avec son grand nodachi, Iori va exécuter la plus rapide des cinq techniques de l'école Ôgame !!

C'est désormais Iori qui fait face, à la place de Ran, au Dieu de la mort Raiô Magami ! Une bataille sans merci s'engage alors entre ces deux monstres classés parmi les neuf meilleures des Cent Lames. Au même moment, Gama Kurogane, lui aussi participant au Grand Tournoi du shogunat, est sur la route...

Gama contre Shinnojô !! Leur duel est devenu un combat où chacun met sa vie en jeu ! Gama va asséner un coup terrible que même Shinnojô n'a jamais vu ! De son côté, Zenmaru engage aussi un combat à mort face à un adversaire redoutable ! C'est un vieil homme classé 99e sur la liste des Cent Lames, mais sa main cache un sinistre secret...

Enfin arrivée à l'hôtel, Ran veut trouver la force de vivre comme une sabreuse et demande à Iori d'être son professeur. Mais ce dernier est aussi en proie au doute après son difficile combat contre Raiô. Iori n'a pas le temps de souffler qu'un nouveau membre des Cent Lames l'attaque ! Il se retrouve cerné par Ikki Ôbayashi, classé 54e, et plusieurs dizaines de combattants aguerris. Mais alors qu'Iori déchaîne son sabre tel un démon, un ennemi encore plus fort fait son apparition !!

Iori admet qu'il ne prend plus de plaisir au sabre et choisit de quitter Gama et Zenmaru pour se rendre à Edo avant eux. Ran le suit, déterminée à apprendre les techniques de l'école Ôgame auprès d'Iori. Son objectif : défier une des Cent Lames afin de s'emparer de ses rouleaux. Son adversaire sera Burai Udô de l'école Seishin ! Face à cet épéiste capable de trancher un rocher, Ran pourra-t-elle faire valoir son art ?

Enfin, le Grand Tournoi du shogunat entre dans sa phase principale !! Mais Yagira, le maître d'armes des Tokugawa, rend d'abord visite à Iori. Il lui révèle le secret qui se cache derrière ce tournoi, ainsi que la présence d'un homme terriblement fort ! D'autre part, Shimon Kudô, de l'école Muhô, interpelle Gama. Cerné par trois experts de l'école Muhô, Gama est contraint de faire un choix !!

La phase principale du tournoi débute sur l'île des déportations surnommée la « Prison d'Asura ». L'adversaire d'Iori est Kitarô Mashima de l'école Myôjin, qui a un passif à régler avec lui. Kitarô est le frère aîné de « Sasuke et sa Beninuki », une des Quatre Lances divines, tué au cours du tournoi Unabara. Il a juré de le venger et assaille Iori telle une bête sauvage...

Sur l'île de la déportation dite « Prison d'Asura », on peut entendre les cris de lamentation d'hommes forts ! Kyôyasai Yagira, l'homme le plus fort du shogunat, affronte Hyôgo Shakujii, le rejeton d'une famille de guerriers. Tadaie Hiramatsu, le monstre inhumain, affronte Raiô Magami, un autre monstre. De son côté, Zenmaru va devoir faire face à Shirô Momose, 9 un virtuose de l'escrime européenne. Quelle est donc cette technique qui lui permet de réduire à l'impuissance le terrible sabre Sadanaga Kutaragi ?

Gama et Naoyoshi se retrouvent enfin ! Pourquoi Naoyoshi collabore-t-il avec l'école Muhô ? Quel est ce dernier souhait que formule Naoyoshi à Gama ? L'heure de faire un choix crucial approche pour Gama ! Shungaku Tôjô, qui était un personnage-clé de l'école Muhô, affronte Seiya Zôin, un excellent combattant envoyé par le shogunat. Au milieu de toutes ces intrigues, Tôjô choisit sa voie !

Alors qu'il se réunit avec les hommes forts de l'école Muhô, son ennemie jurée, quelle réponse Gama va-t-il donner à Shimon ? De son côté, Iori est à nouveau appelé par Yagira, qui l'informe de la décision de Gama. Quelle sera la réaction d'Iori, qui est à la fois un sabreur et son condisciple ? En outre, Bihômaru, l'ogre obéissant directement àTadaie Hiramatsu, attaque Ran !! Écoutera-t-elle les conseils d'Iori qui lui avait dit de fuir ?!

Shura contre Ogre, le choc !! Lequel des deux est le plus fort ?! Afin de récupérer Ran, Iori défie Bihômaru. Face à un adversaire dont la chair résiste même au sabre, comment Iori va-t-il s'y prendre ? Mais alors que le combat approche de son dénouement, un individu fait irruption ! Face à ce développement inattendu, comment la partie va-t-elle évoluer ?!

Il ne reste plus que deux duels durant ce premier tour de la phase principale du grand tournoi. Qui est donc ce mystérieux sabreur de l'école Ôgame, Hanjirô Okamoto ? Iori, grièvement blessé par Tadaie Hiramatsu, est ramené tant bien que mal à Edo après la fin du premier tour, mais il n'ouvre toujours pas les yeux... À l'approche du deuxième tour, le shogunat mobilise des assassins. Tadaie, quant à lui, s'intéresse à Gama ! Comment ce dernier réagira-t-il face à l'homme qui a vaincu son condisciple ?

Deux ans ont passé depuis la fin du légendaire Grand Tournoi d'Unabara durant lequel de nombreux combattants ont risqué leur vie afin de déterminer qui était le plus fort d'entre eux. Iori Sengoku, devenu le "guerrier sans égal", reçoit une invitation de la part du shogunat Tokugawa. Il va devoir défendre son titre. Ses adversaires seront des combattants triés sur le volet par le gouvernement. Leur nom : les Cent Lames du shogunat. Que le Tournoi Ultime commence !

Les Genkai Tempei, les guerriers les plus puissants du shogunat, en ont après... Gama !! Karai, membre de cette unité, parvient à retrouver Iori et Gama. Grâce à sa variété de coups, son impressionnante vitesse et sa technique de battement, il réussit à mettre ce dernier dos au mur. Gama va alors sortir sa technique Kamuï ! Pendant ce temps, les autres membres des Genkai Tempei, avec Ramon à leur tête, se rendent à la résidence du fief de Suruga afin d'y trouver Tadaie Hiramatsu !!

Quel sera le résultat de l'assaut des Genkai Tempei sur la résidence du fief de Suruga à Edo ?! Randô Shakujii, le maître d'armes de Suruga, va affronter Ramon Ise, le chef des Genkai Tempei, dans un duel intense qui va enfin trouver son dénouement. Comment Tadaie Hiramatsu, cerné par ses ennemis, va-t-il réagir ? Gama, lui, reçoit la visite de Shinnojô, le chef de l'école Ôgame, qui l'interroge au sujet de son rôle au sein de l'école Muhô, leur vieille ennemie !!

Le kata du ciel et de la terre, legs de Jinsuke, est dévoilé ! Gama, qui assiste à une démonstration de ce sixième kata, en perce immédiatement toute l'essence. Iori, de son côté, se libère de l'illusion de Jinsuke et recommence à marcher sur le chemin de la force ultime. Au même moment, un plan secret pour tuer le shogun, fomenté par l'école Muhô, est mis à exécution. Un homme que l'on croyait mort va faire sa réapparition...

Le projet d'assassinat mené par l'école Muhô portera-t-il ses fruits ? Grâce au travail d'Ikariya, un espion infiltré au sein du shogunat, Jingû parvient enfin à acculer le shogun. Mais Kyôyasai Yagira, le Rempart du shogunat, se met en travers de sa route ! Parviendra-t-il à réaliser le rêve de Jinsuke : renverser le shogunat ? De son côté, Gama, qui a découvert le plan de Jingû, part à l'assaut du château d'Edo avec l'école Muhô !

Guerre totale entre l'école Muhô et le shogunat !! La déclaration de guerre de Gama ouvre un nouveau chapitre !Gama et ses compagnons ont envahi le château d'Edo afin de secourir Jingû. Les membres de l'école Muhô affrontent chacun les hommes forts du shogunat.Quels guerriers survivront au chaos du 2e tour du tournoi et se qualifieront pour le 3e ?

Avant le troisième tour sont désignés les participants qui se disputeront le titre de guerrier sans égal ! Iori acquiert de nouvelles compétences au terme de son entraînement avec Riko et Shinnojô, qu'il va éprouver en se portant volontaire pour le premier duel ! Le combat commence entre les démons de la guerre qui veulent satisfaire leur ambition !