Depuis sa plus tendre enfance, Gakurô Yajima peut voir de mystérieuses entités appelées “esprits”. Mais loin de le réjouir, ce don est à ses yeux une malédiction. Afin de les éviter au maximum, le lycéen a choisi d’adopter une attitude discrète au quotidien. Cette vie tranquille bascule le jour où il fait la rencontre de Nue, un esprit à l’apparence de jeune fille, scellé au sein de son lycée. Décelant un potentiel chez Gakurô, Nue propose de lui céder une part de son pouvoir afin de vaincre les spectres qui hantent sa ville. Par crainte, Gakurô refuse, mais une situation critique va l’amener à changer d’avis, pour le meilleur... et pour le pire ?

Shiroha, sur ordre de la puissante famille Fujino, défie Nue dans l’espoir de lui voler son pouvoir. Alors qu’elles se livrent une bataille sans merci, Nue, qui pourtant domine largement l’affrontement, s’arrête pour faire une étrange proposition à son adversaire impliquant Gakurô. Ce dernier devra vite gagner en expérience pour se montrer à la hauteur ! Plus tard, les membres du club d’occultisme se voient confier une nouvelle mission... à la plage !

Le duel entre Shiroha et Gakurô s’est conclu par la victoire du lycéen ! Afin de protéger la jeune exorciste de son propre clan, qui voit d’un très mauvais oeil sa défaite, Nue la convainc de s’installer au lycée Kita. Pour la première fois, Shiroha goûte à la paix. Cependant, le patriarche des Fujino ne compte pas en rester là. Afin de récupérer les pouvoirs de Nue, il envoie l’ancien mentor de Shiroha l’affronter. Une bataille sans merci entre deux géants s’annonce !

La 6e brigade des troupes d’éradication vient de voir le jour, avec Gakurô à sa tête ! Alors que ses amis et lui attendent que le Q.G. des exorcistes leur assigne leur première mission, une folle rumeur s’empare du lycée Kita ! Très rapidement, la situation dérape et Kazusa est victime d’un sortilège... C’est l’heure pour Gakurô de faire ses preuves en tant que capitaine !

L’heure est grave ! Portée par son désir de vengeance, Shitotsu s’est jetée sur l’esprit de niveau 3 qui avait assassiné son père sous ses yeux, lorsqu’elle était enfant. À cause de la puissance démesurée de ce monstre, le combat tourne rapidement en défaveur de la jeune exorciste. L’aide de Gakurô permettra-t-elle à la fratrie de reprendre le dessus sur leur ennemi juré ?

Suite au combat contre un esprit de niveau 3, au village de Mitori, Gakurô estime ne pas être à la hauteur de son rôle de capitaine de brigade. C’est pourquoi ses amies et lui acceptent sans hésiter l’entraînement draconien que leur propose Nue afin de développer leurs pouvoirs en prévision d’une future attaque. En effet, dans l’ombre, le groupe des esprits de niveau 4 élabore un plan machiavélique afin de libérer les Hyô. La 6e brigade sera-t-elle prête à temps ?

Pendant que Gakurô affronte en duel l'assassin du fiancé de Kazusa, un esprit de niveau 4, sa coéquipière part sauver les otages de l'hôpital. De leur côté, Shiroha et Shitotsu sont restées au lycée Kita, afin d'affronter un autre puissant adversaire. L'enjeu des combats est fatidique : Gakurô et ses amis doivent tout tenter pour empêcher l'ennemi de s'emparer de l'épée rituelle de Nue !