Edition spéciale : en exclusivité, les pages couleurs parus dans le célèbre magazine Shonen Jump ! Même dans le Japon moderne, les ninjas agissent toujours dans l'ombre. Le jeune prodige Yodaka a reçu une mission, protéger la lycéenne Aoi à tout prix. Mais il ignore encore qu'en plus de devoir affronter des adversaires redoutables, il va être confronté à un univers impitoyable pour un phobique des interactions sociales... le lycée !

Yodaka et Hibari ont réussi à se débarrasser du nukenin qui voulait kidnapper Aoi. Mais leur vie au lycée n'allait pas pour autant se calmer ! En pleines préparations de la fête du sport, alors que Yodaka a toujours autant de mal à s'intégrer, ce dernier va faire une demande à Umineko...

Après avoir repoussé l'attaque surprise d du ninja déserteur Tobi et être revenu sain et sauf, Yodaka découvre à quel point Aoi est sincèrement soulagée de le voir en sécurité. Face à cette réaction, il commence à ressentir un trouble inédit dans son coeur ! Comme si cela ne suffisait pas, Suzume, une nouvelle ninja chargée de la protection d'Aoi, se porte volontaire pour endosser le rôle de son ''petit ami'' de couverture ?!

Alors qu'il pensait fêter tranquillement l'anniversaire d'Aoi, Yodaka doit plutôt essuyer un revers majeur : il échoue à une mission ! Mimizuku pourra-t-il encore faire confiance à cette unité 9 pour la suite de la mission d'escorte ? Il leur laisse une dernière chance, pendant des vacances à la mer...